近亲结婚的夫妇，有可能从他们共同祖先那里获得同一基因，并将之传递给子女，假如这一基因按常染色体隐性遗传的方法，其子女就有可能由于突变纯合子而发病，因此近亲婚配增加了某些常染色体隐性遗传性疾病的发生风险，简单出现高隐性遗传病的病发率、多种基因遗传病的高发病率、后代畸形、后代体质差等问题。
一、近亲结婚的害处
1、近亲结婚会大大提升隐性遗传病的概率。依据有关资料证明，近亲结婚后代的隐性遗传病将是非近亲结婚后代隐性遗传病的150倍。
2、近亲结婚的某些多基因遗传病的发病率高于非近亲结婚。据调查，近亲结婚的后代所患的先天性心脏病、无脑儿、脊髓分裂转变等多基因病的发病率约为1.64%，高于非近亲结婚子女的0.57%。
3、近亲结婚的孩子早期死亡率和畸形率也比较高。
4、近亲结婚的后代体质会比较差，体重较轻，身高较矮。
二、近亲结婚的后代简单得的病症
1、先天智力低下。
2、先天性心脏病。
3、先天愚型。
4、地中海贫血。
5、苯丙酮尿症。
6、高血压。
7、白化病。
8、精神分裂症。
9、先天性心脏病。
10、癫痫。
